爱德华和阿尔冯斯兄弟为了复活死去的母亲,进行了禁忌的人体炼成。炼成失败后,爱德华失去了左腿和右臂,阿尔冯斯则失去了整个身体,灵魂被固定在盔甲中。为了找回失去的一切,兄弟俩踏上了寻找贤者之石的旅程,逐渐揭开了国家军部背后的阴谋。